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Repositorio sobre el nuevo coronavirus 2019 de MIDAS


Descargo de responsabilidad
La mayoría de las secciones de este repositorio están en desarrollo activo y pueden estar incompletas. La información publicada en este repositorio fue creada por aquellos que aparecen como creadores en los metadatos y no por el Centro de Coordinación de MIDAS. Los creadores deben ser reconocidos cuando se utilice la información para trabajos científicos o de otro tipo (ver Información para los usuarios).

Introducción

Este repositorio sirve como plataforma central para compartir recursos relevantes para el modelado del brote de COVID-19. El Centro de Coordinación de MIDAS (MCC) ha creado y lo mantendrá en colaboración con la extensa comunidad de modelado. Se anima a los miembros de la comunidad a aportar recursos al repositorio y así apoyar el esfuerzo general de investigación sobre la COVID-19. Consulte Información para colaboradores para obtener información sobre cómo contribuir con el material. Comuníquese con questions@midasnetwork.us si tiene preguntas o ideas de mejoras, o para enviar o solicitar que se incluye algún material.

Lista de difusión sobre el nuevo coronavirus 2019 de MIDAS

El Centro de Coordinación de MIDAS mantiene una lista de correo dedicada para enviar actualizaciones y noticias sobre la investigación de modelado de la COVID-19. Para unirse a la lista de difusión, envíe un correo electrónico a questions@midasnetwork.us.

Datos

Todas las fuentes de datos relevantes para el modelado de la COVID-19 se pueden cargar/encontrar aquí, incluso datos de recuento de casos y listados de líneas. Los datos son cargados por el MCC y por los miembros de la comunidad. Los datos pueden estar en muchos formatos y niveles diferentes de conservación. Los conjuntos de archivos de datos relacionados se presentan como "colecciones". Por ejemplo, una colección puede ser un conjunto de actualizaciones de situaciones de brote relacionadas de un país, un conjunto de archivos de copias de seguridad con marca de tiempo u otro conjunto de archivos relacionados. Cada colección tiene sus propios metadatos, guía de datos y diccionario de ubicación que asigna las ubicaciones geográficas enumeradas en la colección a los estándares internacionales. Consulte Información para colaboradores para obtener información sobre los metadatos y las plantillas de guía de datos más recientes.

Estimaciones de parámetros

Las estimaciones de parámetros se almacenan en un archivo CSV con estimaciones de parámetros epidemiológicos relevantes para el modelado del nCoV. Las estimaciones se extraen de una variedad de fuentes, incluidos los informes del modelo preliminar, las impresiones preliminares y las publicaciones revisadas por pares. Para cada parámetro, también se extraen metadatos. Los cálculos de parámetros son extraídos por un equipo de curadores del Centro de Coordinación de MIDAS y miembros de la comunidad. Un subconjunto del archivo CSV se muestra en un archivo README. Las estimaciones de nuevos parámetros se pueden agregar anexando al archivo CSV (consulte Información para colaboradores).

Estimaciones de parámetros para el nuevo coronavirus 2019

Estimaciones de parámetros para el SARS

Próximamente

Estimaciones de parámetros para MERS

Próximamente

Estimaciones de parámetros para la gripe estacional

Próximamente

Herramientas de software

En esta sección se incluirán herramientas de software para procesamiento de datos, modelado y visualizaciones junto con metadatos relevantes. Un archivo de catálogo CSV incluye todas las herramientas, cada una en una fila independiente, y todas las herramientas se enumeran aquí. Las nuevas herramientas se pueden agregar anexando al archivo CSV o enviando un problema.

Documentos

Todos los documentos relevantes para la COVID-19 se publican en esta sección. Los documentos están organizados principalmente por país o por tema. Las preimpresiones y los manuscritos de revisión por pares se publican con enlaces a páginas web externas solo mientras que todos los demás documentos también se almacenan en este repositorio como colecciones en la carpeta de documentos. Agregue nuevos documentos enviando un problema con la información del documento.

Los documentos incluyen: * Informes, incluso informes/actualizaciones de situación de los brotes, informes de modelado y otra "literatura gris" * Preimpresiones y publicaciones revisadas por pares, organizadas por tema * Pautas de la OMS, China y los CDC de los EE. UU. relacionadas con la COVID-19

Información para colaboradores

Cualquiera puede contribuir a este repositorio a través de solicitudes de extracción (pull requests). Se anima a los miembros de la comunidad a aportar nuevos datos y hallazgos, y a ayudar a que este repositorio sea cada vez más completo y útil. Esta sección incluye instrucciones detalladas para solicitudes de extracción y plantillas de metadatos, guías de datos y otros formatos de archivo y estándares de contenido. Envíe un correo electrónico a questions@midasnetwork.us en caso de preguntas o ideas.

Información para usuarios

Muchas personas han contribuido a la creación de este repositorio y de su contenido. Cite a los creadores de datos u otro contenido listado en los metadatos respectivos si utiliza alguna de sus contribuciones. Cite también este repositorio como la fuente de esas contribuciones según la siguiente cita sugerida: "Creadores de objeto, nombre del objeto, recuperados de: MIDAS 2019 Novel Coronavirus GitHub Repository, URL (Repositorio de GitHub sobre el nuevo coronavirus 2019 de MIDAS, URL). Fecha de acceso"

Información de contacto

Si tiene preguntas o comentarios relacionados con este repositorio, envíe un problema o comuníquese con el Centro de Coordinación de MIDAS.

MIDAS Coordination Center
University of Pittsburgh
A737 Public Health
130 DeSoto Street
Pittsburgh PA 15261
Estados Unidos
Tel.: +1 412-624-7693
Correo electrónico: questions@midasnetwork.us