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Repositório do MIDAS sobre o novo coronavírus 2019


Isenção de responsabilidade
A maioria das seções deste repositório está em desenvolvimento e pode estar incompleta. As informações publicadas neste repositório foram criadas pelas pessoas listadas como autores nos metadados e não pelo Centro de Coordenação do MIDAS. Os autores devem ser reconhecidos ao usar as informações em trabalhos científicos ou para outros fins (consulte Informações para os usuários).

Introdução

Este repositório serve como uma plataforma central para compartilhar recursos relevantes para a modelagem da epidemia da COVID-19. Ele foi criado pelo Centro de Coordenação do MIDAS (MCC) e será mantido em colaboração com a comunidade de modelagem global. Os membros da comunidade são incentivados a contribuir com recursos para o repositório e, dessa forma, apoiar o esforço geral de pesquisa da COVID-19. Consulte as Informações para colaboradores para obter orientações sobre como contribuir com o material. Em caso de dúvidas ou sugestões de melhoria, ou para enviar/solicitar materiais para incluir, entre em contato pelo e-mail questions@midasnetwork.us.

Lista de distribuição do MIDAS Coronavírus 2019

O Centro de Coordenação do MIDAS mantém uma lista de discussão dedicada para atualizações e notícias sobre a pesquisa de modelagem da COVID-19. Para participar da lista de distribuição, envie um e-mail para questions@midasnetwork.us.

Dados

Todas as fontes de dados relevantes para a modelagem da COVID-19 podem ser carregadas/encontradas aqui, incluindo dados de contagem de casos e listas de linhagem. Os dados são carregados pelo MCC e pelos membros da comunidade. Os dados podem estar em diferentes formatos e níveis de curadoria. Os conjuntos de arquivos de dados relacionados são apresentados como "coleções". Por exemplo, uma coleção pode ser um conjunto de atualizações relacionadas à situação da epidemia em um determinado país, um conjunto de arquivos de backup com informação de data/hora ou outro conjunto de arquivos relacionados. Cada coleção tem seus próprios metadados, guia de dados e dicionário de localização que mapeia as localizações geográficas listadas na coleção de acordo com os padrões internacionais. Consulte as Informações para colaboradores para obter os metadados e modelos de guia de dados mais recentes.

Estimativas de parâmetros

As estimativas são armazenadas em um arquivo CSV com estimativas de parâmetros epidemiológicos relevantes para a modelagem do nCoV. As estimativas são extraídas de uma variedade de fontes, incluindo relatórios de modelos preliminares, pré-prints e publicações revisadas por pares. Para cada parâmetro, os metadados também são extraídos. As estimativas de parâmetros são extraídas por uma equipe de curadores do Centro de Coordenação do MIDAS e membros da comunidade. Um subconjunto do arquivo CSV é mostrado em um arquivo LEIAME. Novas estimativas de parâmetros podem ser adicionadas ao arquivo CSV (confira as Informações para colaboradores).

Estimativas de parâmetros para o novo coronavírus 2019

Estimativas de parâmetros para SARS

Em breve

Estimativas de parâmetros para MERS

Em breve

Estimativas de parâmetros para a gripe sazonal (influenza)

Em breve

Ferramentas de software

As ferramentas de software para processamento de dados, modelagem e visualizações serão incluídas nesta seção, juntamente com os metadados relevantes. Um arquivo de catálogo CSV inclui todas as ferramentas, cada uma em uma linha separada, e todas as ferramentas estão listadas aqui. Novas ferramentas podem ser adicionadas ao arquivo CSV ou enviando um problema.

Documentos

Todos os documentos relevantes para a COVID-19 estão publicados nesta seção. Os documentos são organizados por país ou tópico. Pré-prints e artigos revisados por pares são publicados com links para páginas da Web externas, enquanto que todos os outros documentos são armazenados neste repositório como coleções na pasta de documentos. Adicione novos documentos enviando um problema nas informações do documento.

Os documentos incluem: * Relatórios, como relatórios/atualizações sobre surtos, relatórios de modelagem e “literatura cinzenta” * Pré-prints e publicações revisadas por pares, organizados por tópico * Diretrizes da OMS, da China e do CDC (EUA) relacionadas à COVID-19

Informações para colaboradores

Qualquer pessoa pode contribuir para este repositório por meio de solicitações pull. Os membros da comunidade são incentivados a contribuir com novos dados e descobertas, além de ajudar a tornar este repositório cada vez mais completo e útil. Esta seção inclui instruções detalhadas para solicitações pull e modelos para metadados, guias de dados e outros formatos de arquivos e padrões de conteúdo. Em caso de dúvidas ou comentários, envie um e-mail para questions@midasnetwork.us.

Informações para os usuários

Várias pessoas contribuíram para a criação deste repositório e de seu conteúdo. Cite os autores dos dados ou do conteúdo listado nos respectivos metadados se usar alguma de suas contribuições. Além disso, não deixe de citar este repositório como a fonte dessas contribuições de acordo com a seguinte citação sugerida: “Autores do objeto, nome do objeto, obtido em: Repositório GitHub do MIDAS sobre o novo coronavírus 2019, URL. Acesso em "

Informações de contato

Em caso de dúvidas ou comentários relacionados a este repositório, envie um problema ou entre em contato com o Centro de Coordenação do MIDAS.

Centro de Coordenação do MIDAS
Universidade de Pittsburgh
A737 Public Health
130 DeSoto Street
Pittsburgh PA 15261
Estados Unidos
Tel.: +1 412-624-7693
E-mail: questions@midasnetwork.us